小麦穗发芽是指小麦在收获前，其穗上的种子出现发芽的现象。当小麦成熟期遭遇连续阴雨天气，且收获延迟，潮湿的麦粒在穗上可能会发芽，这会显著影响产量和种子的食用品质。此外，若在种子田中出现穗发芽，则会降低秋播时种子的发芽率和田间出苗率，对下季小麦的生产造成不利影响。例如，2008年北方冬麦区在收获期遭遇较多降雨，导致某些品种的小麦出现了严重的穗发芽，进而影响了秋播小麦种子的发芽率和出苗率。因此，对小麦穗发芽问题的关注至关重要。
小麦种子在成熟时虽具有一定的休眠期，但仍有部分种子休眠性较弱。在降雨后，种子吸水膨胀，加之适宜的温度，便容易萌动发芽。尤其是那些休眠期较短的白皮品种或某些红皮品种，在成熟期如果因降雨无法及时收获，其种子在田间经历休眠期后，更容易发生穗发芽。
为预防穗发芽，首要措施是选择抗穗发芽能力强的品种或成熟时间较早的品种。其次，要密切监测天气预报，尽量在降雨来临前完成收获，并且收获后要尽快晾晒，以防止种子在堆放过程中发芽。
